В 1975 году вместо изготовлявшегося спортивно-тренировочного ружья Иж-25 завод приступил к выпуску ружья аналогичного назначения модели Иж-39. Смена моделей спортивных ружей объясняется тем обстоятельством, что произошла смена базовых моделей — вместо ружья Иж-12, являвшегося базой для ружей Иж-25, на производство были поставлены ружья Иж-27.
Ружья Иж-39 изготовляются в четырех вариантах исполнения. Иж-39К и Иж-39Т — ружья, предназначенные для круглого и траншейного стендов без механизмов автоматического выбрасывания стрелянных гильз. Аналогичные ружья с эжекторными механизмами имеют в своем обозначении дополнительную букву «Е» - Иж-39ЕК и ИЖ-39ЕТ.
При разработке нового спортивного ружья был принят во внимание накопленный опыт эксплуатации ружей Иж-25 и в его конструкцию были внесены существенные изменения, направленные на улучшение эксплуатационных характеристик, в том числе эргономических.
Ложи ружей для круглого и траншейного стендов имеют различные конфигурации, наилучшим образом соответствующие условиям применения оружия. Цевью придана наиболее удобная для удержания и управления ружьем форма. Стволы оснащены более широкой прицельной планкой (10—14 мм) с яркой цветной мушкой, улучшившей условия прицеливания.
Существенные изменения произведены в конструкции узла запирания стволов в коробке. В средней перемычке коробки установлен специальный опорный вкладыш, к которому плотно подгоняется передняя стенка заднего крюка стволов, значительно разгружая шарнирное соединение ствола с коробкой во время выстрелов и повысившая технический ресурс ружья.
Спусковой механизм ружья Иж-39 значительно отличается от использовавшегося в Иж-25 и в первых выпусках ружей Иж-27Е-1С. Его удалось значительно усовершенствовать, сделав более надежным в работе и простым в изготовлении. Вместо довольно сложного переключателя с боковыми пружинами на его переднем выступе и непростого в изготовлении правого шептала в новом механизме значительно упростились сами детали и их взаимодействие, а работа всего механизма стала более надежной. Изменился привод от запорной планки к толкателю спускового крючка.
Вместо запрессовывавшегося в задний торец запорной планки толкателя применено качающееся на одной оси со спусковым крючком коромысло (поводок), которое давлением заднего торца, отводимой назад при открывании ружья запорной планки, поворачивается и задним концом отклоняет толкатель назад. Приклад ложи изготовляется с выступом под щеку, чем достигается более однообразное положение ружья при изготовке к стрельбе. В ружье Иж-39Т устанавливается ложа типа «Монте-Ка рло».
Наибольшие конструктивные изменения произошли в спусковом механизме. На переключателе спереди имеется фигурный выступ, взаимодействующий с задним концом коромысла, на заднем верхнем выступе на оси устанавливается подпружиненный переводчик, выполняющий функции боковых пружин на ружье Иж-25.
Инерционный разобщитель тоже стал проще, меньших размеров и с более узким пазом, предназначенным только для прохода переключателя. Функция его осталась прежней — задержать производство второго выстрела при отдаче, т.е. предупредить сдвоенный выстрел.
Взаимодействие деталей ударно-спускового механизма в ружье Иж-39 принципиально не отличается от ружья Иж-25. Затем этот механизм используется и в ружьях Иж-27Е-1С.